Dans les premiers temps, le dortoir du Crac des Chevaliers occupait sans doute l’un des espaces situés au nord de la grande halle, non loin de la chapelle et des latrines. C’est précisément dans cette zone que sont regroupées une douzaine de latrines qui étaient rincées grâce à un égout venant de la cour. Leur nombre indique que le château n’avait pas encore vocation, dans sa première phase, à accueillir une importante garnison. Ces latrines sont divisées en deux groupes (l’un de quatre et l’autre de huit) distants d’une dizaine de mètres. Cette organisation pourrait témoigner d’une séparation entre les frères de rangs différents, des murs de refend ayant pu isoler les espaces entre eux.
Lors de la seconde campagne de construction, on assiste avec la création du donjon à une hiérarchisation verticale des espaces de vie et de commandement. Peut-être faut-il voir dans ce changement de programme, d’une part, la volonté de mieux isoler les frères des autres occupants de la forteresse, ainsi que des visiteurs et des espaces de service, et, d’autre part, une réponse à l’accroissement de la taille de la garnison permanente.