Les modifications des VII^e et VIII^e siècles concordent avec l'installation d'une première communauté monastique. Cette nouvelle étape de construction n'est attestée par aucun texte et n'a donc pu être restituée qu'au travers des donnés archéologiques. Il semblerait que ce soit principalement le chevet et la basilique qui connaissent des modifications, peut-être engendrées par les nouveaux besoins de la communauté monastique.