Recommandé à Napoléon III pour l'accompagner dans la rédaction de l’Histoire de Jules César, Alfred Maury est nommé secrétaire de la Commission de Topographie des Gaules à sa création. Figure incontournable de son époque, cet érudit devient rapidement indispensable à l'empereur. Pour cette raison, ce dernier le nomme bibliothécaire des Tuileries, afin que son bureau soit à proximité du sien.